Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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UBXN7O94888 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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