Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 PAX6-214ENST00000470027 3587 ntTSL 29.34□□□□□ -0.918e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PHGDH-206ENST00000493622 742 ntTSL 59.34□□□□□ -0.918e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MEF2C-239ENST00000636294 2576 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.918e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NCKAP1L-202ENST00000545638 3612 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.928e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 USP28-215ENST00000545608 733 ntTSL 59.32□□□□□ -0.928e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 STRADA-210ENST00000579318 1307 ntTSL 29.32□□□□□ -0.928e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CLPB-207ENST00000536297 479 ntTSL 59.31□□□□□ -0.928e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 KANSL3-213ENST00000475820 583 ntTSL 39.31□□□□□ -0.928e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NARS2-202ENST00000525345 861 ntTSL 59.31□□□□□ -0.928e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LINC00922-201ENST00000564041 1243 ntTSL 1 (best)9.31□□□□□ -0.928e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 IL15RA-217ENST00000532039 679 ntTSL 59.31□□□□□ -0.928e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ADTRP-208ENST00000512139 713 ntTSL 59.31□□□□□ -0.928e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HERPUD2-203ENST00000413517 808 ntTSL 59.31□□□□□ -0.928e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HERPUD2-206ENST00000438224 811 ntTSL 39.31□□□□□ -0.928e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 UBN2-201ENST00000473989 14444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.928e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PAX6-209ENST00000419022 6888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.928e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LINC00963-209ENST00000607931 473 ntTSL 59.28□□□□□ -0.928e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RAD52-203ENST00000397230 530 ntTSL 59.28□□□□□ -0.928e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TRIM66-201ENST00000299550 9753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.938e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PHGDH-219ENST00000641513 735 nt9.26□□□□□ -0.938e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC012651.1-203ENST00000466369 3501 ntAPPRIS P1 TSL 29.25□□□□□ -0.938e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NEDD4L-214ENST00000586263 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.938e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NLRC4-201ENST00000342905 1362 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.938e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PLCG2-213ENST00000567980 2892 ntTSL 1 (best)9.24□□□□□ -0.938e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PAX6-259ENST00000639916 2622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.938e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TMEM161B-209ENST00000511087 2804 ntTSL 1 (best)9.22□□□□□ -0.938e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CCDC144NL-AS1-217ENST00000583481 710 ntTSL 39.2□□□□□ -0.948e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BANF1-204ENST00000524663 251 ntTSL 39.2□□□□□ -0.948e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FNDC3A-206ENST00000541916 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.943e-7■■■■■ 107
SF3B1O75533 RIF1-208ENST00000457745 1006 ntTSL 1 (best)9.17□□□□□ -0.948e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SRI-204ENST00000431660 1418 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.948e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ARHGAP24-204ENST00000502537 725 ntTSL 39.14□□□□□ -0.958e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ABI1-209ENST00000376166 3441 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.958e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 VAPB-201ENST00000265619 3596 ntTSL 29.12□□□□□ -0.958e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FRMD4A-211ENST00000632570 662 ntTSL 59.09□□□□□ -0.958e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 USP54-211ENST00000474929 590 ntTSL 49.09□□□□□ -0.958e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LINC00963-219ENST00000624390 472 ntTSL 59.09□□□□□ -0.958e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RAP1GDS1-218ENST00000512857 583 ntTSL 49.09□□□□□ -0.958e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MEF2C-220ENST00000513252 1063 ntTSL 59.07□□□□□ -0.968e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MYO9A-217ENST00000568042 1922 ntTSL 59.06□□□□□ -0.968e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MED26-206ENST00000601478 558 ntTSL 49.05□□□□□ -0.968e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ARIH2-220ENST00000482342 441 ntTSL 29.04□□□□□ -0.968e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 VAPB-206ENST00000520497 937 ntTSL 29.04□□□□□ -0.968e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SOCS6-203ENST00000582322 2625 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.978e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AF279873.3-203ENST00000521541 661 ntTSL 29□□□□□ -0.978e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PPP2R1B-206ENST00000527614 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.978e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NCALD-227ENST00000523923 549 ntTSL 48.99□□□□□ -0.971e-10■■■■■ 107
SF3B1O75533 BCL6-203ENST00000419510 4178 ntTSL 28.99□□□□□ -0.978e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PAX6-282ENST00000640975 2553 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.978e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TOMM40L-207ENST00000475793 487 ntTSL 28.98□□□□□ -0.978e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SPATS2L-207ENST00000409397 920 ntTSL 38.97□□□□□ -0.978e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 IPP-201ENST00000359942 1947 ntTSL 1 (best)8.96□□□□□ -0.978e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 GTF2A1-203ENST00000553612 6306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.988e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC008764.4-205ENST00000593459 222 ntAPPRIS P1 TSL 38.96□□□□□ -0.988e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ERGIC1-205ENST00000519796 578 ntTSL 48.95□□□□□ -0.988e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC124944.3-203ENST00000570130 3508 nt8.94□□□□□ -0.988e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TMCC1-202ENST00000426664 5484 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.988e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BTBD10-204ENST00000525864 1325 ntTSL 1 (best)8.92□□□□□ -0.988e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PCDH10-202ENST00000511112 968 ntTSL 48.89□□□□□ -0.998e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 GLS-205ENST00000409626 997 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.998e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZNF726-202ENST00000334589 847 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.998e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 STRADA-233ENST00000638888 1718 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.998e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZNF148-202ENST00000465763 566 ntTSL 48.85□□□□□ -0.998e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC139493.2-203ENST00000512260 534 ntTSL 48.84□□□□□ -0.998e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SOCS6-202ENST00000578377 894 ntTSL 38.84□□□□□ -0.998e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MEF2C-221ENST00000514015 2772 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.998e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PTK2-253ENST00000523805 440 ntTSL 38.83□□□□□ -18e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 C1D-205ENST00000470189 665 ntTSL 38.83□□□□□ -18e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZNF33A-208ENST00000628825 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -18e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC019080.1-204ENST00000627798 790 ntTSL 38.83□□□□□ -18e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 IPP-202ENST00000396478 3113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -18e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CASP8-205ENST00000358485 2930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -18e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 KLHL8-202ENST00000425278 4049 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -18e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BAZ2B-213ENST00000483316 6838 ntTSL 1 (best)8.82□□□□□ -18e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 IQGAP2-217ENST00000514350 2617 ntTSL 1 (best)8.81□□□□□ -18e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RHPN2-202ENST00000544458 3793 ntTSL 28.8□□□□□ -18e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FLT1-203ENST00000540678 1927 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -18e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC093297.2-202ENST00000514597 659 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -18e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FLJ21408-204ENST00000566854 601 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -18e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ALMS1-206ENST00000613296 12925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -18e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 VWA5A-205ENST00000456829 4388 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -18e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZNF81-203ENST00000376950 492 ntTSL 58.78□□□□□ -18e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PBRM1-206ENST00000409114 5015 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.018e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DIEXF-202ENST00000491415 8446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.018e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PPA1-205ENST00000610026 3524 ntTSL 28.76□□□□□ -1.018e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 STT3A-204ENST00000525652 607 ntTSL 28.76□□□□□ -1.018e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NCALD-215ENST00000520690 548 ntTSL 48.76□□□□□ -1.011e-10■■■■■ 107
SF3B1O75533 ECHDC1-207ENST00000430841 1009 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.018e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FLOT2-205ENST00000580313 429 ntTSL 38.74□□□□□ -1.018e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AFG1L-201ENST00000368977 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.018e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 STRADA-246ENST00000640397 1045 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.018e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 KLHL8-208ENST00000512111 3245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.028e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RAD21L1-203ENST00000409241 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.028e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZNF620-204ENST00000433723 421 ntTSL 38.69□□□□□ -1.028e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FXR2-205ENST00000573957 582 ntTSL 38.68□□□□□ -1.028e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 EHBP1-207ENST00000426940 586 ntTSL 48.68□□□□□ -1.028e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FGD6-201ENST00000343958 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.028e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PARP4-201ENST00000381989 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.028e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ANKRD42-202ENST00000393389 4066 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.028e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PAX6-270ENST00000640368 6975 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.028e-6■■■■■ 107
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