Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms