Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms