Protein–RNA interactions for Protein: O43745

CHP2, Calcineurin B homologous protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP2O43745 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP2O43745 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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CHP2O43745 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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CHP2O43745 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP2O43745 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP2O43745 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP2O43745 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP2O43745 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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