Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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