Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TO15178 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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