Protein–RNA interactions for Protein: O00743

PPP6C, Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP6CO00743 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP6CO00743 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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