Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms