Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms