Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms