Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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