Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAN1Q9Y2M0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms