Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms