Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms