Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms