Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms