Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms