Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms