Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms