Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms