Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PSD3Q9NYI0 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PSD3Q9NYI0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PSD3Q9NYI0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PSD3Q9NYI0 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PSD3Q9NYI0 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PSD3Q9NYI0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PSD3Q9NYI0 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PSD3Q9NYI0 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSD3Q9NYI0 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSD3Q9NYI0 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSD3Q9NYI0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSD3Q9NYI0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSD3Q9NYI0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSD3Q9NYI0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSD3Q9NYI0 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSD3Q9NYI0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSD3Q9NYI0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSD3Q9NYI0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms