Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN6Q9NWW5 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms