Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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