Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms