Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms