Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms