Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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FOXQ1Q9C009 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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FOXQ1Q9C009 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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FOXQ1Q9C009 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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FOXQ1Q9C009 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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