Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms