Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SETD2Q9BYW2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms