Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms