Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPATA9Q9BWV2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPATA9Q9BWV2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms