Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms