Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms