Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYD88Q99836 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms