Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms