Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms