Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms