Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COG3Q96JB2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms