Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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