Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTP4Q96DX8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms