Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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