Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms