Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms