Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHMTQ93088 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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