Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMPDL3BQ92485 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3BQ92485 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms