Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.3 ms