Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY6

ZFP28, Zinc finger protein 28 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 868 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP28Q8NHY6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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ZFP28Q8NHY6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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ZFP28Q8NHY6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFP28Q8NHY6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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