Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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