Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7P3

CLDN22, Claudin-22, humanhuman

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN22Q8N7P3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CLDN22Q8N7P3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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CLDN22Q8N7P3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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CLDN22Q8N7P3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CLDN22Q8N7P3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CLDN22Q8N7P3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CLDN22Q8N7P3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN22Q8N7P3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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